ATA單證冊的主要目的是為提供貨物如違反外國海關暫時進口條款時，海關能徵收所有關稅、稅項等的一項可接受擔保。該擔保金額必須為相當於貨物的總值，並有百分之十的附加費用；發證機構保留按個別情況以釐訂擔保之金額的權利。

必須以下列其中之一作為擔保：

• 現金 (壹萬澳門圓為限)
• 銀行支票
• 銀行擔保函

所有擔保，無論是現金或銀行擔保函，需以ATA單證冊發證之日起計，至少保留有33個月的擔保期。

如果ATA單證在正確使用完畢後退還給發證機構，則擔保機構可考慮給予“有條件註銷”，並在短時間內交回保證金/擔保。